又请众人建言献策之后，他开始发布命令。
第一，令湖广总督马士英领黄得功刘良佐牛成虎继续追剿张献忠的残余，务必全面剿灭，不使一人漏网。除了湖广之外，也要调动江西巡抚郭都宪，令其守卫群山的各个隘口，不使流贼逃出群山，窜入江西。
第二，流贼俘虏的处置和难民的安置，则由南京户部和湖广总督马士英、以及宋一鹤李乾德，还有江西巡抚郭都宪共同负责，务必妥善安置，不使其再生祸乱。所需钱粮，由南京户部和扬州转运筹集。
第三，虎大威刘肇基等人全部恢复原职。
-----和陈奇瑜杨尔铭是被圣旨拿走的不同，虎大威等人被革除职位的并非是圣旨，而是兵部的命令，以太子的职权，完全可以覆盖。
第四，朱国弼在京营所做的人事调派，全部作废，回归原样。各营将领和勇士，开始叙功，准备上报朝廷。
最后，在张献忠精锐尽灭，出京任务基本完成的情况下，朱慈烺宣布，京营各部准备班师回朝……
如果崇祯帝康健、京师稳定，没有后顾之忧，朱慈烺说什么也是不会班师回朝的，出京一次不易，他一定要将张献忠连根拔起，彻底解除湖广的贼乱。但现在，崇祯帝病重，京师隐隐风云变幻，所以他不得不压下最初的念头，改变想法，返回京师。
有黄得功刘良佐和牛成虎一万秦兵的相助，又没有了李自成的策应，就算马士英不能彻底剿灭张献忠，也应该可以控制吧
至于左营之乱。现在只能暂时按下，等时机成熟再处置。
想到左营，朱慈烺就皱眉，如果左营四万兵马在，官军兵力充足，他有何必担忧
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